某会计师事务所接受委托，对某上市公司2006年度财务报表进行审计。注册会计师于2006年12月份对该公司的内部控制进行测试。审计工作底稿部分内容如下：

(1)该公司股东大会批准董事会的投资权限为1亿元以下，董事会决定由总经理负责实施。总经理决定由证券部负责总额在1亿元以下的股票买卖。该公司规定，公司划入营业部的款项由证券部申请，由会计部审核，总经理批准后划转入公司在营业部开立的资金账户。经总经理批准，证券部直接从营业部资金账户支取款项。证券买卖、资金存取的会计记录由会计部处理。注册会计师了解和测试投资的内部控制后发现：证券部在某营业部开启的有关协议及补充协议未经会计部或其他部门审核。根据总经理的批准，会计部已将8000万元汇入该账户。证券部处理证券买卖的会计记录，月底将证券买卖清单交给会计部，会计部据以汇总登记。

(2)该公司控股股东的法定代表人同时兼任该公司的法定代表人，总经理是聘任的。在公司章程及相关决议中未具体载明股东大会、董事会、经营班子的融资权限和批准程序。经了解，该公司由财务部负责融资，2006年根据总经理的批示向工商银行借入了1亿元贷款。

要求：(1)根据上述内容，假定未描述的其他内部控制不存在缺陷，请指出该公司内部控制在设计和运行方面的缺陷，并提出改进建议。

(2)根据对该公司内部控制的了解和测试，请分别指出上述内部控制缺陷与投资交易的何种认定相关。