背景 A公司参与远离所在地炼钢厂的机电安装工程总承包的投标，投标前作了如下工作：1．分析了招标文件工程范围，本工程含机械设备安装、电气及自动化系统安装、钢结构及非标准件制作安装、工业给排水施工、防腐及保温工程、筑炉工程。并分析本公司施工技术力量优劣势，认为本公司安装技术力量雄厚，主体工程及主要系统由本公司承担，其他工程拟采用分包的形式分别分包给具有相应施工资质的公司，并对其经营状况和价格水平进行了调研。2．因本工程是以固定总价，合同包干，一次包死，施工中不发生签证及变更费，因此在标书编前重点调研了工程有关的法律法规，施工所在地的施工条件，气候条件及环境，建设单位的资金情况，参加了标前会议交底和答疑，并认真复核了工程量。3.在施工组织设计编制中，该公司重点描述了企业信誉、施工组织、进度计划、施工装备配置，尤其施工方案的编制内容，得到评标人员及建设单位一致赞许。4.投标过程中严格按时按规定递交了标书，评标时B公司因施工过程估算费用偏高、工程量偏大、计价形式有误等原因造成总价过高，偏离招标规定而出局，而C、D、E三公司也因技术或报价等原因落选。最终A公司中标。A公司进场后，为确保工程安全实施，在组织编制施工组织设计和施工方案的同时，认真编制了应急预案，明确了应急预案的实施要点和应急反应的实施原则。 根据标前调查研究内容要求，本案例A公司在调查研究过程中的重大缺陷有哪些？会产生哪些不良后果？