多选题

内蒙古藏传佛教召庙准格尔召内设有神学院，其神学院可分为（　　）学部。

A时轮学部

B宗教哲学部

C医学部

D教义学部

解析：
准格尔召是伊克昭盟现存最大最完整的黄帽喇嘛教寺院，中间最大的一座召庙称为苏克沁独宫，是整个召庙建筑群的核心，是藏经和举行全召大型集会的地方。召庙内设神学院，共分四大部：洞阔尔独宫为时轮学部，专门传授数学、天文、地理、占卜和历学的场所；却衣仁独宫为宗教哲学部，讲授教教义以及喇嘛教徒演说和辩论的地方；门巴独宫为医学部，传授医学、培养藏医医务人员的地方；独立巴独宫为教义学部，专门传授喇嘛教的教义、教规和教史。